80学时 2分 秋季学期10-12月
上课地点: 生物楼扩建楼K106,K408
本课程是物理学院生物物理专业的本科生课程“生物物理”的配套实验课。依常规的实验流程,依次完成生物大分子(蛋白质)的晶体制备、衍射数据收集及处理、结构解析、结构分析等实验。这使学生在涉及生物大分子晶体学的主要实验方法与技术(包括计算机实验)方面得到系统的训练。经过学习观摹谱仪操作与上机数据处理练习使学生在理解核磁共振理论原理的同时初步了解核磁共振的基本实验方法,数据处理方法,以及常见同核两维谱和异核多维谱的分析方法。主要内容包括:Bruker DMX-500谱仪的主要框架功能;谱仪控制软件XwinNMR的使用;常规一维谱; COSY,DQF-COSY,NOESY,TOCSY等常用同核二维谱以及HSQC,CBCACONH, HNCACB等异核多维谱;核磁数据处理软件包XwinNMR,Nmrpipe,Sparky的使用;以标准样品谱为例,介绍如何利用Sparky等软件,通过同核和异核多维谱进行蛋白质自旋体系的识别与谱峰归属等练习。
实验内容:
一、蛋白质的结晶;
二、晶体收获及衍射数据收集;
三、衍射数据处理;
四、晶体结构精修;
五、核磁共振设备介绍;
六、核磁共振数据分析与处理(一);
七、核磁共振数据分析与处理(二);
八、核磁共振数据分析与处理(三);
九、核磁共振数据分析与处理(四);
十、一维核磁共振实验;
十一、二维核磁共振实验;